wenn bei einer (permanenten) Inventur, die gebucht wurde sich herausstellt, daß manche Stückzahlen doch nicht richtig sind, gibt es dann eine Möglichkeit nur für diese Materialien eine neue Inventur aufzusetzen?

ja Materialien werden in die Inventur aufgenommen einmal im Geschäftsjahr. Damit erhalten die Materialien den Merker Inventur durchgeführt, auch bei permanenter Bestandsführung. Für Materialien mit diesem Merker können jedoch auch wieder Inventurbelege angelegt werden. Einfach den Hacken "bereits Inventarisiert" beachten.

Um welche Transaktion handelt es sich?

in der normalen Transaktion z.B. MI31 den Abschnitt Selektion nach Bestand aufklappen und dort inkl. inventarisierter Materialien aktiv anmarkern.